É possível vincular contratos de venda a NFs de venda já emitidas, assim como é possível vincular PEDIDOS DE COMPRA a NFs de compra já lançadas.
Basta editar a NF e clicar em VINCULAR NEGOCIAÇÃO - Selecionar o contrato / pedido - informar a quantidade da NF e SALVAR.
Confira no vídeo como isso é feito na prática. No final veja como fica o relatório com a NF já vinculada.